Index

_

__enter__() (tolkein.lib.tolog.DisableLogger method)

__exit__() (tolkein.lib.tolog.DisableLogger method)

C

count_taxon_assembly_meta() (in module tolkein.lib.toinsdc)

D

delete_file() (in module tolkein.lib.tofile)

DisableLogger (class in tolkein.lib.tolog)

E

extract_tar() (in module tolkein.lib.tofetch)

F

fetch_file() (in module tolkein.lib.tofetch) fetch_stream() (in module tolkein.lib.tofetch) fetch_tar() (in module tolkein.lib.tofetch)

fetch_tmp_file() (in module tolkein.lib.tofetch) fetch_url() (in module tolkein.lib.tofetch) fetch_wgs_assembly_meta() (in module tolkein.lib.toinsdc)

L

load_yaml() (in module tolkein.lib.tofile)

logger() (in module tolkein.lib.tolog)

O

open_file_handle() (in module tolkein.lib.tofile)

P

parse_ncbi_names_dmp() (in module tolkein.lib.totax) parse_ncbi_nodes_dmp() (in module tolkein.lib.totax)

parse_ncbi_taxdump() (in module tolkein.lib.totax) parse_taxonomy() (in module tolkein.lib.totax)

R

read_file() (in module tolkein.lib.tofile)

readable_bin() (in module tolkein.lib.tobin)

S

stream_fasta() (in module tolkein.lib.tofile)

stream_taxon_assembly_meta() (in module tolkein.lib.toinsdc)

T

tolkein.lib.tobin (module) tolkein.lib.tofetch (module) tolkein.lib.tofile (module)

tolkein.lib.toinsdc (module) tolkein.lib.tolog (module) tolkein.lib.totax (module) TqdmUpTo (class in tolkein.lib.tofetch)

U

update_to() (tolkein.lib.tofetch.TqdmUpTo method)

W

write_file() (in module tolkein.lib.tofile)